Em tempos de poucos titulos de destaque, onde o rival estava ganhando tudo, o Inter revelou grandes jogadores como Nilmar, Daniel Carvalho e Cleiton Xavier. Destaques para a campanha de 1992, quando faturou a Copa do Brasil. Nesse periodo conquistou cinco campeonatos estaduais, sendo o de 2002 vencido de forma invicta.
